2013年9月27日，中国科学技术信息研究所在北京发布中国科技论文统计报告，16种中华医学会系列杂志被评为“中国百种杰出学术期刊”，10篇论文被评为“中国百篇最具影响优秀国内学术论文”，有19种期刊评价指标位列本学科第一，取得了可喜的成绩。

中国科学技术信息研究所承担着我国科技人员在国内外期刊发表论文数量和影响力的统计分析工作，每年定期发布我国科技论文发表趋势和状况，并对SCI、 Medline等国际权威数据库收录的中国科技期刊进行统计。通过分析中国科技核心期刊的各项学术指标，评选出“中国百种杰出学术期刊”，是业内公认的、权威的期刊评价风向标。2012年入选“中国百种杰出学术期刊”的中华医学会系列杂志包括：中华儿科杂志、中华耳鼻咽喉头颈外科杂志、中华放射学杂志、中华妇产科杂志、中华肝脏病杂志、中华骨科杂志、中华检验医学杂志、中华结核和呼吸杂志、中华流行病学杂志、中华泌尿外科杂志、中华内科杂志、中华神经科杂志、中华危重病急救医学、中华心血管病杂志、中华眼科杂志、中华医学杂志。

科技论文作为科技工作者开展科学研究的系统总结和理论结晶，也是衡量科技创新活动最重要的指标。“中国百篇最具影响优秀国内学术论文”是根据各个学科领域的论文数量、规模等，结合我国科技发展重点领域和优先主题，参考文献类型、基金资助、被引用分布点等情况遴选而出。2012年中华医学会系列杂志中有10篇论文被评选为“中国百篇最具影响优秀国内学术论文”，分别刊自：中华危重病急救医学、中华医学杂志英文版中华内科杂志、中华泌尿外科杂志、中华流行病学杂志、中华肝脏病杂志、中华医学杂志、中华儿科杂志、中华肿瘤杂志。

根据2012年《中国科技论文统计结果报告》显示，127种中华医学会系列杂志在31 项学科分类排名中，位列学科排名第1位的期刊共19种，位列学科前3位的期刊共37种。

1.医学综合类：中华医学杂志（1），中华医学杂志英文版（2）；

2.基础医学类：中华病理学杂志（2）；

3.临床医学综合类：中华危重病急救学医学（1）；

4.临床诊断学类：中华检验医学杂志（1）；

5.内科学综合类：中华内科杂志（1）；

6.心血管病学类：中华心血管病杂志（1）；

7.呼吸病学、结核病学类：中华结核和呼吸杂志（1）；

8.消化病学类：中华肝脏病杂志（1），中华消化杂志（2）；

9.血液病学、肾脏病学类：中华肾脏病杂志（1），中华血液学杂志（2）；

10.内分泌病学与代谢病学、风湿病学类：中华内分泌代谢杂志（1），中华风湿病学杂志（2）；

11．外科学综合类：中华外科杂志（2），中华显微外科杂志（3）；

12．普通外科学、胸外科学、心血管外科学类：中华消化外科杂志（1），中华胃肠外科杂志（2）；

13.泌尿外科学类：中华泌尿外科杂志（1）；

14．骨外科学类：中华骨科杂志（1）；

15. 烧伤外科学、整形外科学类：中华创伤杂志（3）；

16. 妇产科学类：中华妇产科杂志（1）；

17．儿科学类：中华儿科杂志（1），中华儿科临床杂志（3）；

18．眼科学类：中华眼科杂志（1）；

19．耳鼻咽喉科学类：中华耳鼻咽喉头颈外科学杂志（1）；

20. 口腔医学类：中华口腔医学杂志（2）；

21．皮肤病学、性病学类：中华皮肤科杂志（2）；

22．神经病学、精神病学类：中华神经科杂志（1），中华行为医学与脑科学杂志（2），中华神经外科杂志（3）；

23．核医学、医学影像学类：中华放射学杂志（1），中华超声影像学杂志（3）；

24．肿瘤类：中华肿瘤杂志（2）；

25．预防医学与公共卫生学综合类：中华预防医学杂志（2）；

26．流行病学、环境医学类：中华流行病学杂志（1）；

27．军事医学与特种医学类：中华航空航天医学杂志（2）；

报告发布的信息，也从一个侧面反映了在科技期刊内忧与外患的今天，中华医学会系列杂志始终将编辑出版精品期刊为已任，仍然坚守学术第一、内容为王的办刊理念。自1887年始，中华医学会系列杂志经历了从无到有、从少到多的积累阶段，现已进入学科全面、出版规范的新时期，并在文化体制改革的大潮中继续激流勇进、拼搏上向，在促进期刊的改革与发展，促进传统出版转型，增强核心竞争力，全面提升系列杂志的整体质量和办刊水平等方面进行不懈的努力和探索，为我国医药卫生期刊的繁荣与发展添砖加瓦、贡献力量。